Det lykkes langt om længe Austin at sende Dr. Evil og Mini-Me bag lås og slå, men da han skal adles for sin gerning, opdager han, at hans far - den legendariske spion Nigel Powers - er blevet kidnappet af superskurken Goldmember og ført tilbage til 1975. Austin drager tilnage i tiden for at redde sin far og resten af verden.